Ngày 27/01/2014, Chính phủ đã ban hành Nghị định số 07/2014/NĐ-CP quy định tổ chức, nhiệm vụ, quyền hạn và quan hệ phối hợp của Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố các cấp. Theo đó, Thủ tướng Chính phủ làm Trưởng ban Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố quốc gia; Phó trưởng ban là Bộ trưởng Bộ Công an. Cơ quan Thường trực của Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố quốc gia là Bộ Công an. Các thành viên Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố quốc gia gồm: Bộ trưởng, Chủ nhiệm Văn phòng Chính phủ; Bộ trưởng các Bộ: Ngoại giao, Giao thông vận tải, Thông tin và Truyền thông, Y tế, Tài chính; Thống đốc Ngân hàng Nhà nước Việt Nam, Thứ trưởng Bộ Công an phụ trách công tác an ninh (Thành viên thường trực), Tổng tham mưu trưởng Quân đội nhân dân Việt Nam, Thứ trưởng Bộ Quốc phòng. Thành phần Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố của bộ, ngành do một Thứ trưởng là Trưởng ban, các thành viên khác do Bộ trưởng, thủ trưởng cơ quan ngang bộ quyết định. Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương do Chủ tịch UBND tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương làm Trưởng ban. Trong thành phần tham gia Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương có Tư lệnh Bộ Tư lệnh Thủ đô Hà Nội (đối với Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố của TP. Hà Nội), Tư lệnh Bộ Tư lệnh TP. Hồ Chí Minh (đối với Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố của TP. Hồ Chí Minh), Chỉ huy trưởng Bộ Chỉ huy quân sự các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương (đối với Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương). Nhiệm vụ, quyền hạn của Ban Chỉ đạo phòng, chống khủng bố các cấp cũng được Nghị định quy định này quy định rõ. Nghị định số 07/2014/NĐ-CP có hiệu lực thi hành kể từ 25/3/2014.