Ngày 14/6/2013, tại Đà Nẵng, Đoàn công tác của Bộ GTVT do Thứ trưởng Nguyễn Văn Công làm Trưởng đoàn, đã làm việc với UBND TP. Đà Nẵng về công tác di dời Nhà máy Đóng tàu Đà Nẵng và di dời cảng Sông Hàn. Cục trưởng Nguyễn Nhật tham gia đoàn công tác của Bộ GTVT làm việc với UBND TP. Đà Nẵng

Tham dự buổi làm việc, về phía Cục HHVN có Cục trưởng Nguyễn Nhật, Giám đốc Cảng vụ HH Đà Nẵng Vương Ngọc Châu; đại diện Tổng công ty HHVN, Tập đoàn CNTT Việt Nam và UBND TP. Đà Nẵng… Qua trao đổi thảo luận, các bên đã đi đến thống nhất một số nội dung: Yêu cầu Tập đoàn CNTT Việt Nam, Nhà máy Đóng tàu Đà Nẵng khẩn trương di dời, bàn giao mặt bằng cho Công ty CP Đầu tư Thuận Phước; thời gian bàn giao chậm nhất là đến 30/6/2013. Kéo dài thời gian khai thác cảng Sông Hàn đến 30/6/2014 để Công ty TNHH MTV cảng Đà Nẵng và Tổng công ty HHVN có điều kiện xây dựng hoàn thiện cảng mới Sơn Trà giai đoạn 1 thay thế cảng Sông Hàn, nhằm tạo điều kiện duy trì hoạt động SXKD của cảng Đà Nẵng, các chủ hàng, chủ tàu. Bộ GTVT phối hợp cùng với UBND TP. Đà Nẵng sẽ có kế hoạch làm việc với Bộ Tư lệnh vùng 3 Hải quân, Bộ Quốc phòng về việc xây dựng tuyến luồng mới phục vụ cho các cảng ở khu hậu cần cảng địa phương trong thời gian tới. Cùng ngày, Cục trưởng Nguyễn Nhật đến thăm và làm việc với Cảng vụ Hàng hải Đà Nẵng. Tại buổi làm việc, Giám đốc Cảng vụ Vương Ngọc Châu đã báo cáo tình hình hoạt động hàng hải tại khu vực cảng biển Đà Nẵng, bao gồm hoạt động khai thác các cầu, bến cảng và các luồng hàng hải tại khu vực; quy hoạch phát triển cảng biển Đà Nẵng thời gian tới, đặc biệt là công tác di dời cảng Sông Hàn và di dời Nhà máy Đóng tàu Đà Nẵng theo yêu cầu của TP. Đà Nẵng cũng như xây dựng các bến cảng mới thay thế các cảng di dời; những khó khăn, vướng mắc trong quá trình thực hiện. Sau khi nghe Giám đốc Cảng vụ báo cáo, Cục trưởng Nguyễn Nhật đã chỉ đạo và động viên CBCC Cảng vụ thực hiện tốt chức năng nhiệm vụ được giao cũng như xem xét giải quyết các kiến nghị của đơn vị. Thay mặt Cảng vụ, Giám đốc Vương Ngọc Châu cảm ơn sự quan tâm giúp đỡ của Cục HHVN thời gian qua và mong tiếp tục nhận được sự quan tâm của Cục trưởng, lãnh đạo Cục và các phòng ban của Cục Hàng hải trong thời gian tới. Cục trưởng Nguyễn Nhật chỉ đạo và động viên CBCC Cảng vụ thực hiện tốt chức năng nhiệm vụ được giao